1、 骨骼因素
由于牙齿生长在颌骨上，上下颌骨的相互关系对上下牙弓间的颌关系有直接影响，可以表现在前后向、水平向以及垂直向上的变化。同时，牙槽骨容纳、支持牙齿，其本身又受颌骨的支持，但上下牙槽骨之间的关系不一定与上下颌骨间的关系完全一致。再者，骨作为整个头骨的一部分，还受到颅底位置的影响。
2、肌肉因素
牙齿萌出并发挥功能是受咀嚼肌、舌肌和面部肌肉控制的。舌、唇和颊肌对引导牙齿进入最后位置起着重要作用，故这些肌肉形态和功能的改变能够影响牙齿的位置和牙颌关系。
3、牙量和颌骨量的比例
在理想状况下，颌骨应有足够的间隙供牙齿萌出、建颌而不发生拥挤畸形。但在现代人群中，很多人存在着牙量与骨量的比例失衡，从而表现为不同类型、不同程度的错颌畸形。
4、局部因素
牙齿的异位萌出(如上尖牙唇向错位)、牙齿数目异常(如多生牙、先天缺失牙)以及唇、舌系带位置的异常，均会引起颌发育的改变，导致错颌畸形。
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